CITACA cuenta con las instalaciones del nuevo edificio singular del Campus da Auga, donde cuatro grupos de la Facultad de Ciencias tienen asignados laboratorios adicionales, además de un espacio especial con características específicas para la investigación en hidrología. En dicho centro se localiza, además, la sede de CITACA, que dispone de un espacio propio, identificado y de uso exclusivo para la celebración de reuniones, seminarios y cualquier otra actividad promovida por el clúster, y donde se aloja la Secretaria Técnica.
En concreto, se asignaron os siguientes laboratorios del mencionado edificio:
- Laboratorio de Nutrición y Bromatología (Grupo AA1)
- Laboratorio de Edafología y Química Agrícola (Grupo BV1)
- Laboratorio de Tecnología y Diagnóstico Ambiental (LTDA) (Grupo BV1)
- Laboratorio de Tecnología de Alimentos (Grupo EQ4)
- Laboratorio de Biotecnología Industrial e Ingeniería Ambiental (Grupo EQ11)
- Laboratorio de Informática Aplicada (Grupo LIA2)
- Espacio en el Laboratorio Común de Hidrología (Grupo BV1)